機械システムコース（きかいシステムコース、英: Course of Mechanical Systems）は工学部機械知能工学科のコースの一つ。
機械情報コースと名前が違う以外で特に相違点はない。授業も同じものが多く、また研究室を決める際も両コースの研究室の中から選択が可能である。また、機械知能学科の公式サイトでも、両コースに特に違いがないことが述べられている。
敢えて相違点を挙げるならば，各科目の難易度が担任により大きく異なることがある．例えば，熱力学Ⅰである．システムコースの熱力学Ⅰの存在が為に情報コースを選択する学部生，移行生も少なくないと言われている．
